Die folgende Liste führt alle Flohkrebse der Schweiz auf. Einige Arten wurden bisher noch nicht definitiv nachgewiesen (graue Schrift), sind aber aufgrund der grenznahen Verbreitung oder Ausbreitungsprozessen in naher Zukunft zu erwarten. Mit einem * markierte Arten sind nicht-einheimische Arten, die nach 1900 eingewandert sind. Mit einem † markierte Arten sind in der Schweiz ausgestorben.
Ordnung Amphipoda
Unterordnung Senticaudata
Infraordnung Talitrida
Hyalellidae Bulycheva, 1957
Hyalella S.I. Smith, 1874
Hyalella azteca Saussure, 1858
Talitridae Rafinesque, 1815
Cryptorchestia Lowry & Fanini, 2013
Cryptorchestia garbinii Ruffo, Tarocco & Latella 2014
Talitroides Bonnier, 1898
Talitroides alluaudi (Chevreux, 1896) *, †
Infraordnung Corophiida
Corophiidae Leach, 1814
Chelicorophium Bousfield & Hoover, 1997
Chelicorophium curvispinum (G. O. Sars, 1895) *
Chelicorophium robustum (G. O. Sars, 1895) *
Chelicorophium sowinskyi (Martynov, 1924) *
Infraordnung Bogidiellida
Bogidiellidae Hertzog, 1936
Bogidiella Hertzog, 1933
Bogidiella albertimagni Hertzog, 1933
Infraordnung Gammarida
Crangonyctidae Bousfield, 1973
Crangonyx Bate, 1859
Crangonyx pseudogracilis Bousfield, 1958 *
Crangonyx subterraneus Bate, 1859
Synurella Wrzesniowski, 1877
Synurella ambulans (F. Müller, 1846) *
Niphargidae Bousfield, 1977
Niphargus Schiödte, 1849
Niphargus aquilex Schiödte, 1855
Niphargus auerbachi Schellenberg, 1934
Niphargus brixianus Ruffo, 1937
Niphargus caspary Pratz, 1866
Niphargus cf. stygius Komplex [Niphargus B]
Niphargus forelii Humbert, 1877
Niphargus inopinatus Schellenberg, 1932
Niphargus luchoffmanni Fišer, Alther, Zakšek, Borko, Fuchs & Altermatt, 2018
Niphargus muotae Fišer, Konec, Alther, Švara & Altermatt, 2017
Niphargus murimali Fišer, Konec, Alther, Švara & Altermatt, 2017
Niphargus puteanus Koch, 1836
Niphargus rhenorhodanensis Komplex Schellenberg, 1937
Niphargus setiferus Schellenberg, 1937
Niphargus styx Fišer, Konec, Alther, Švara & Altermatt, 2017
Niphargus thienemanni Schellenberg, 1934
Niphargus thuringius Schellenberg, 1934
Niphargus tonywhitteni Fišer, Alther, Zakšek, Borko, Fuchs & Altermatt, 2018
Niphargus virei Chevreux, 1896
Pontogammaridae Bousfield, 1977
Obesogammarus Stock, 1974
Obesogammarus obesus Sars G.O., 1894
Obesogammarus crassus Sars G.O., 1894
Pontogammarus Sowinsky, 1904
Pontogammarus robustoides Sars G.O., 1894
Gammaridae Latreille, 1802
Dikerogammarus Stebbing, 1899
Dikerogammarus bispinosus Martynov, 1925
Dikerogammarus haemobaphes (Eichwald, 1841) *
Dikerogammarus villosus (Sovinskij, 1894) *
Echinogammarus Stebbing, 1899
Echinogammarus berilloni (Catta, 1878) *
Echinogammarus ischnus Stebbing, 1899 *
Echinogammarus stammeri S. Karaman, 1931
Echinogammarus trichiatus (Martynov, 1932) *
Gammarus Fabricius, 1775
Gammarus balcanicus Schäferna, 1922
Gammarus fossarum Koch, 1835; Typ A (= fossarum s. str.)
Gammarus fossarum Koch, 1835; Typ B
Gammarus fossarum Koch, 1835; Typ C
Gammarus lacustris s. l. Komplex G. O. Sars, 1863 (= G. alpinus Alther, Fišer & Altermatt, 2017)
Gammarus pulex (Linnaeus, 1758)
Gammarus roeselii Gervais, 1835 *
Gammarus tigrinus Sexton, 1939 *
Gammarus wautieri A. L. Roux, 1967